دانلود نرم افزار آنالیز پروتئین VMD
دانلود نرم افزار آنالیز پروتئین VMD
دانلود نرم افزار آنالیز پروتئین VMD
فرمت فایل: word
تعداد صفحه:72
دانشگاه آزاد اسلامی
واحد کرج
دانشکده کشاورزی
مقطع کارشناسی ارشدسمینار 1
موضوع:
پروتئین های مرتبط با بیماریزایی
فهرست مطالب
مقدمه و خلاصة موضوع
گیاه، عامل بیماری و اساس ژنتیکی دفاع گیاهی
فرضیة ژن در برابر ژن
جداسازی و مطالعة ژنهای مقاومت
حوزه های ساختمانی فرآورده های ژنهای مقاومت
تکرارهای غنی از لوسیون
مکانهای اتصال نوکلئوتیدها
لوسین زیپرها
حوزه مشابه گیرنده های
پروتئین های LRR خارج سلولی و غیر
گیرنده های کینازی در عرض غشاء
شباهت بین فرآورده ژنهای R با سایر پروتئین های گیاهی
ژنهای مقاومت و انتقال پیام دفاعی
ژنهای غیر بیماری زا و تولید لیگاند
رویدادهای پائین دست در انتقال پیام دفاعی
خانواده ژنهای مقاومت و ایجاد مقاومت های اختصاصی جدید
پروتئین های مرتبط با بیماری زایی
گروه بندی پروتئینهای
خانواده
بتا – 1،3 – گلوکانازها
کیتیناز ها (خانواده های PR-11, PR-8, PR-4c, PR-3)
پروتئین های شبه تا ماشین (خانواده PR-5)
مهار کننده های پروتئیناز (خانواده PR-6)
پروکسیداز ها (خانواده PR-9)
دفسین ها ، نیوتین ها، پروتئین های ناقل لیپید و اکسالات اکسیدازها (خانواده های PR-12 ، PR-13 ، PR-14، PR-15 ، PR-16)
مهندسی مقاومت به بیماری ها
فهرست منابع
17 ص
پروتئین
پروتئینها یکی از انواع ماکرومولکولهای زیستی هستند که از زیرواحدهایی بنام اسید آمینه ساخته شدهاند.
پروتئینها، زنجیرهای خطی یا پلیمرهایی هستند که از ترکیب اسیدهای آمینه حاصل میشوند. چون ترتیبهای نامحدودی در توالی و طول زنجیره اسید آمینهها در تولید پروتئینها وجود دارد، از این رو انواع بی شماری از پروتئینها نیز میتوانند وجود داشته باشند.
پروتئینها در بخشی درون سلول به نام ریبوزوم توسط RNA ساخته میشوند.
کارکردهای پروتئینها
رفتار سلولی و تمام فعالیتهایی که در سلول انجام میشود بر عهده پروتئینها است. همه پروتئینها یا هم برهمکنش دارند و تقریباً میتوان گفت که همه پروتئینها اثر خود را با همکاری پروتئینهای دیگر در سلول اعمال میکنند و هیچ پروتئینی نیست که در سلول به تنهایی عمل کند. برای ساخت پروتئن در سلول مراحل ذیل باید انجام شود. 1) DNA باید رونویسی شود. در این مرحله آنزیم RNA پلی مراز دو رشته DNA از هم جدا میشود و بعد رونوسی آغاز میشود. نکته: اطلاعات در DNA بصورت رمز 3 تایی وجود دارد یعنی هر 3 نوکئوتید معرف 1 رمز و هر رمز معرف 1 اسید آمینه است. 2) RNA پلی مراز مانند قطاری بر روی DNA حرکت میکند. و رونوسی ادامه دارد. 3) بعد در آخر رونوسی RNA پلی مرآز به رمز پایان میرسد و رونویسی به پایان میرسد.
11 ص
تعریف عیار پروتئین:
اسیدینه ای را که در واکنش فوق ظاهر میگردد میتوان در مجاورت فنل فتالئین با سود تیتره نموده و از روی عبارت پروتئین به نسبت درصد پروتئینهای موجود در شیر پی برد. عیار پروتئین که به (Eiweisstiter=Et) نشان داده میشود عبارتست از تعداد میلی لیترهای سودکه برای 25 میلی لیتر شیر لازم است تا پس از اضافه کردن فرمالدئید در مجاورت فنل فتالئین رنگ استاندارد بدست آید عیار پروتئین در شیرهای تازه نسبت درصد مقدار پروتئین را نشان میدهد.
وسائل لازم برای آزمایش:
درصورت امکان می توان از دستگاه سنجش پروتئینهای شیر ساخت ژربر استفاده نمود. این دستگاه شامل بورتیست که ستون مدرج آن نسبت درصد پروتئینها را مستقیماً در 25 میلی لیتر شیر نشان میدهد.
معرف های لازم برای آزمایش:
در صورت امکان میتوان از معرفهای آماده ساخت ژربر که برای 200 آزمایش کافیست استفاده نمود.
مشخصات نمونه مورد آزمایش:
شیر مورد آزمایش نباید حاوی مواد نگهدارنده مانند بی کرمات دوپتاس یا فرمل باشد نمونه را قبل از آزمایش بحرارت 20 درجه سانتیگراد رسانده و بدون اینکه کف کند خوب بهم میزنیم.