پروتئین ها نقش قاطعی را در سیستم زیست شناسی بازی می کنند. هر چند اطلاعات لازم برای ارزیابی و سازمانهای زیست شناسنانه سلولها در DNA شکل می گیرد، ولی فرآیندهای زیست شناسی و شیمیایی که زندگی سلول ارگانیسم را حفظ می کنند به شکل انحصاری توسط آنزیم ها وارد عمل می شوند. هزاران آنزیم کشف شده اند. هر یک از آنها واکنش زیست شناسانه خیلی خاصی را در سلولها کاتالیز می کنند. علاوه بر فعالیت آنها به عنوان یک آنزیم، پروتئین ها نیز به عنوان عنصری سازنده از سلولها و ارگانیسم های پیچیده فعالیت
می کنند. برگردان و واژگونی پروتئین ها ضرورتاً از شکل گیری های شیمیایی آنها شکل
می گیرد. پروتئین ها پلیمرهای خیلی پیچیده ای می باشند، از 20 اسید آمینه مختلف شکل گرفته اند. توابع زیست شناسی بی شماری که توسط پروتئین ها شکل گرفته اند ممکن است شدنی نباشند ولی برای پیچیدگی در ترکیب شان، که افزایشی به گروه بسیار از ساختارهای سه بعدی می دهد با توابع زیست شناسی مختلفی شکل می گیرد. به منظور تصویب اهمیت زیست شناسانه آنها، این ریز ملکولها پروتئین نام گرفته اند. که از کلمه یونانی proteois گرفته شده است که به معنای نوع اول می باشد.
در سطح عنصری، پروتئین در بر دارنده 50 الی 55 درصد کربن، 6 الی 7 درصد هیدروژن، 20 الی 23 درصد اکسیژن و 12 الی 19 درصد نیتروژن می باشد و هم چنین 2/0 الی 0/3 درصد سلفور می باشد. سنتز پروتئین در ریبوزوم ها شکل می گیرد. بعد از سنتز، برخی اسید آمینه های شکل گرفته با آنزیم های سیتوپلاسمیک تعیین می شوند. این امر ترکیب عنصری برخی پروتئین ها را تحت تأثیر قرار می دهد. پروتئین هایی که از لحاظ آنزیمی در سلول تعیین نمی شوند هوموپروتئین نام دارند و آنهایی که تعین شده اند و یا با عناصر غیر پروتئینی پیچیده اند، پروتئین های در هم آمیخته با هترو پروتئین ها نام دارند. عناصر تشکیل دهنده غیر پروتئینی اغلب تحت عنوان گروه های prosthetic شناخته شده اند. مثالهای موجود در زمینه پروتئین های در هم آمیخته شامل پروتئین های هسته ای (ریبوزوم) پروتئین های شیرین (K-cosein, ovalbumin) فسفو پروتئین ها (casein ها Kinase, ها و phosphory – lases ها می باشند) لیپو پروتئین ها (پروتئین زرده تخم مرغ چندین پروتئین پلاسما) و متالو پروتئین ها می باشند. Glyco و فسفو پروتئین ها در بر دارنده کربو هیدرات های متصل هم ظرفیت می باشد و گروه های فسفات، پیچیدگی ها می توانند تحت شرایط خاصی از این قائله مجزا باشند.
همچنین پروتئین ها می توانند طبق ساختار سازمانی خالص خودشان طبقه بندی شوند. بنابراین پروتئین های globular آن دسته پروتئین هایی می باشند که در شکل های نیم کره ای و یا بیضی شکل وجود دارند که در نتیجه تا کردن زنجیره های پلی پتپیید در خودش
می باشند.
از سوی دیگر، پروتئین های فیبری ملکولهای میله ای شکلی می باشند که در بر دارنده زنجیره های پلی پتپیید خطی می باشند. پروتئین های فیبری نیز می توانند به عنوان نتیجه ای از اجتماع خطی پروتئین های globular کوچک شکل بگیرند، مثل آکتین و فیبرین. اکثریت زیادی از آنزیم ها پروتئین های globular می باشند و پروتئین های فیبری به شکل نامتنوعی به عنوان پروتئین های ساختاری عمل می کنند.
توابع زیست شناسانه مختلفی از پروتئین ها می تواند به عنوان کاتالیزهای آنزیم طبقه بندی شود، یعنی پروتئین های ساختاری، پروتئین های منقبض شده، هرمونها، پروتئین های انتقالی و آنتی بادی ها.
2-6 خواص فیزیکی/ شیمیایی اسیدهای آمینه
1-2-6 خواص کلی
1-1-2-6 ساختار و طبقه بندی
اسیدهای آمینه واحد ساختاری کلی پروتئین ها می باشند. این اسید آمینه ها در بر دارنده یک اتم کربن - می باشند که به شکل هم ظرفیتی به اتم هیدروژن گروه آمینی و گروه کربوکسیل و یک گروه R زنجیره کناری می رسد.
پروتئین های طبیعی از 2- اسید آمینه مختلف اولیه ای شکل گرفته اند که توسط رشته های amide به هم وصل می شوند. این اسیدهای آمینه فقط در حالت شیمیایی گروه زنجیره کناری R فرق می کنند. خواص فیزیکی / شیمیایی مثل شارژ شبکه، حلال بود، واکنش شیمیایی و پتانسیل رشته بندی هیدروژن از اسیدهای آمینه وابسته به ماهیت شیمیایی گروه R می باشند.
اسیدهای آمینه می تواند در چند مقوله قرار گیرند که مبنی بر درجه قابل زنجیره کناری با آب می باشد. اسیدهای آمینه با زنجیره کناری aromatic , aliphatic به شکل هیدروفوبیک می باشند. و به علاوه قابلیت حل محدود شده ای را در آب به نمایش
می گذارند. اسیدهای آمینه قطبی کامل در آب حلال می باشند و هم شارژ و هم بدون شارژ می باشند. زنجیره کناری Lys , Arg در بر دارنده گروه های آمینه و guanidine می باشند. و بنابراین به شکل مثبتی در PH خنثی شارژ می باشند. گروه imidazol از His در طبیعیت اساسی می باشد.
شامل 210 صفحه فایل word قابل ویرایش
دانلود تحقیق اسیدهای آمینه ، پپتیدها و پروتئین ها
