موضوع فارسی :محاسبه ثبات نسبی و میانگین پستها در طول باقی مانده قطعات در پروتئین تغییرات کنفورماسیونی
موضوع انگلیسی :<!--StartFragment -->
Computing the Relative Stabilities and the Per-Residue Components in Protein Conformational Changes
تعداد صفحه :8
فرمت فایل :PDF
سال انتشار :2013
زبان مقاله : انگلیسی
مولکول های پروتئین اغلب تغییرات کنفورماسیونی تحت. به منظور به دست آوردن بینش به نیروهای که چنین تغییراتی، این امر می تواند مفید به یک روش است که محاسبه سهم هر مانده به انرژی آزاد تبدیل. در اینجا، ما توصیف '' باهم تعریف-تبدیل-آزادی '' (CCR) روش است که قابل اجرا به تغییرات بزرگ ساختاری. ما نشان می دهد که CCR درستی پیش بینی ایالات پایدار از چندین آفتاب پرست '' توالی که قبلا برای شبیه سازی مولکولی به چالش کشیدن. CCR اغلب می تواند بهتر از پیش بینی بدتر از مدل های پروتئین بومی در ارزیابی انتقادی از پیش بینی ساختار پروتئین (CASP) تمایز قائل شوند. ما نشان می دهد که چگونه انرژی های رایگان تبدیل کل می توان به اجزای انرژی رایگان در هر باقی مانده تجزیه شده است. چنین تجزیه بینش که اسیدهای آمینه ترین مسئول تحولات داده شده است را می دهد. به عنوان مثال، در اینجا ما قادر به '' مهندسی معکوس '' اصول طراحی شناخته شده از پروتئین آفتاب پرست. این باز می شود تا این امکان را برای بهبود سیستماتیک در توابع به ثمر رساند ساختار پیش بینی، در طراحی پروتئین سوئیچ ساختاری، و در تفسیر مکانیزم پروتئین در سطح آمینو اسید است.
دانلود مقاله ISI محاسبه ثبات نسبی و میانگین پستها در طول باقی مانده قطعات در پروتئین تغییرات کنفورماسیونی
