فرمت فایل : power point (لینک دانلود پایین صفحه) تعداد اسلاید : 50 اسلاید
بخشی از اسلایدها :
پاورپوینت جامع درباره شیمی ابر مولکول ها
فرمت فایل : power point (لینک دانلود پایین صفحه) تعداد اسلاید : 50 اسلاید
بخشی از اسلایدها :
کتاب Molecular Orbitals and Organic Chemical Reactions
نسخه ی student و refrence
انتشارات وایلی
نسخه ی الکترونیکی این کتاب در سایت وایلی 114 یورو می باشد
اتم اکسیژن فراوان ترین عنصر در پوسته زمین است و در اتمسفر و آب برای شکلهای هوازی حیات مورد نیاز می باشد مخزن اکسیژن کره زمین نتیجه ساخته شدن آن از واکنشهایی مانند فتو سنتز است 37 EMOL و 1 EMOL=108 MOLES. فتوسنتز واکنشی است که در آن دی اکسیژن (2O) از آب آزاد میشود دی اکسیژن تقریبا بطور دائمی در تنفس استفاده میشود و بیشتر از آن جهت استفاده میشود که پذیرنده نهایی الکترون است. اتم اکسیژن در آنواع مولکولهای آلی بوسیله تنوعی از واکنشهای آنزیمی (مانند اکسیژن ساز) و غیر آنزیمی ثابت میشود.
موجودات بی هوازی هر چند از عهده اثر مخالف اکسیژن بر می آیند. در غلظت بالاتر از اکسیژن اتمسفر، دی اکسیژن ممکن است (2O) بازدارنده یا غیر فعال کننده آنزیم معینی باشد و یا اینکه ممکن است با CO2 برای ثابت شدن بوسیله 1، 5 – بیسفسفات کربوکسیلاز اکسیژناز رقابت کند که این باعث میشود که ارزش انرژیتیک فتوسنتز افزایش یابد. بطور کلی اثر سمی اکسیژن به طور عمده توسط مشتقات واکنشی (واکنش پذیر) آن اعمال میشود، در حالیکه دی اکسیژن در حالت پایدار اتم نسبتا غیر قابل واکنش است و می تواند در حالت آرامش همراه مواد الی وجود داشته باشد اجباراتی جزئی از ساختار آنها گردد. این ویژگی توسط چرخشهای موازی دو الکترون جفت نشده دی اکسیژن، که دارای یک سدانرژی برای واکنش اکسیژن با ترکیبات غیر رادیکال است (ممانعت چرخش) نشان داده میشود.
برای اینکه اکسیژن به طور شیمیایی واکنش پذیر باشد باید بطور فیزیکی یا شیمیایی فعال شود. فعالیت فیزیکی بطور عمده توسط انتقال انرژی تحریک از یک رنگیزه فعال شده با نور همانند کلروفیل تحریک شده به اکسیژن اتفاق میافتد با جذب انرژی کافی چرخش یک الکترون معکوس میشود. اولین حالت منفرد از اکسیژن (به صورت O2 یا 2 نشان داده میشود) یک نوع واکنش پذیر متداول است. این حالت اکسیژن قابلیت انتشار زیادی دارد و قادر به واکنش با ملکولهای الی است (که الکترونها معمولا جفت شده هستند) و به غشاهای فتوسنتزی آسیب میرسانند.
فعالیت شیمیایی مکانیزم دیگری برای ممانعت چرخش الکترون و فعال کردن است. این عمل توسط احیا یونی والنت (یک ظرفیتی)دی اکسیژن با افزایش الکترونهای یکی توسط دیگری آنجام می گیرد. چهار الکترون و چهار پروتون برای احیا کامل اکسیژن به آب نیاز است. همه سه حد واسط احیا یک ظرفیتی(univatent) مثلا سوپر اکسید O2o. پراکسید هیدروژن (H2o2) رادیکال هیدروکسیل OHo از نظر شیمیایی فعالند و از نظر فیزیولوژیکی سمی هستند این سمیت به وسیله نیمه عمرها ی کوتاه آنها قبل از واکنش با ترکیبات سلولی و در مقایسه با نیمه عمر دیاکسیژن انعکاس داده میشود، (بیشتر از 100 ثانیه جدول 1) نوع اکسیژن واکنشی که با یک ملکول الی برخورد میکند یک الکترون را از آن خارج میکند و در یک واکنش زنجیره ای به صورت رادیکالهای پراکسیل(Rooo) و آلکوکسیل (Roo) درآید.
سوپر اکسید اولین تولید احیا شده از حالت بنیادی اکسیژن است که این توانایی را دارد هم از اکسید شدن و هم از احیا شدن ایجاد شود این ماده با چند ماده تولیدی از واکنشهای دیگر ممکن است واکنش دهد که این عمل بطور خود به خود و یا بوسیله آنزیمهای جهش نیافته منجر به تولید H2o2 میشود.
پراکسید هیدروژن یک رادیکال آزاد نبوده اما بعنوان اکسید کننده و عامل احیا کننده در تعدادی از واکنشهای درون سلولی شرکت میکند بر خلاف سوپر اکسید، H2o2 انتشار بیشتری از میان غشاها و بخشهای کردهبندی شده سلول داشته و ممکن است مستقیما آنزیمهای حساس را در غلظت کم غیر فعال کند مانند سوپر اکسید، H2o2 پایداری بیشتری دارد. بنابراین از دیگر آنواع آن اکسیژنهای واکنش اثر سمی کمتری دارد تهدید عمده سوپر اکسید و H2o2 در توانایی آنها به تولید زیاد رادیکالهای هیدروکسیل واکنشدار میباشد.
شامل 59 صفحه فایل word قابل ویرایش
فایلهای PDB در خیلی از شبیه سازیها می تواند استفاده شود. فایل PDB تعدادی از مولکولها در اینترنت وجود دارد که شما می توانید براحتی تهیه نمایید. در این آموزش طریقه درست کردن فایلهای PDB برای یک مولکول دلخواه را با استفاده از نرم افزار material studio ارایه شده است. در اینجا ساختار را به شکل خیلی ساده نقاشی میکنیم و سپس با استفاده از میدان نیروی مناسب (Force Field) ساختار رو بهینه (Optimum) میکنیم. سپس آن را به فرمت PDB ذخیره میکنیم. در این آموزش همچنین شما با نحوه ایجاد یک مونومر با ساختار دلخواه و درست کردن یک زنجیره پلیمر آشنا خواهید شد. آموزش در محیط ویندوز و فرمت فایل avi و مدت آموزش ۱۸ قیقه است.این آموزش توی سیستم عامل ویندوز تهیه شده و قابل انجام است. تاریخ انتشار ۹۵/۲/۵
chemissian نرم افزاری بسیار کاربردی در زمینه آنالیز و تجزیه و تحلیل اشعه ماوراء بنفش و طیف های الکترونیکی است. این نرم افزار برای دانشجویان رشته شیمی و فیزیک بسیار مفید و پرکاربرد می باشد، همچنین دارای رابط گرافیکی کاربر پسندی است. ازجمله قابلیت های کلیدی این نرم افزار می توان به ساخت نمودارهای مداری برای سهولت کار، ساخت نمودار سطح انرژی از مولکول های اوربیتال، بررسی ماهیت پیوند در مولکول، تولید نقشه های دو بعدی، تجزیه و تحلیل چرخش توزیع چگالی و … اشاره کرد.
قابلیت های کلیدی نرم افزار Chemissian:
– دارای رابط گرافیکی کاربر پسند
– ساخت نمودارهای مداری برای سهولت کار
– ساخت نمودار سطح انرژی از مولکول های اوربیتال
– ساخت، تجسم و تفسیر نور ماورای بنفش
– بررسی ماهیت پیوند در مولکول (محاسبه کوانتومی و شیمیایی)
– تولید نقشه های دو بعدی
– تجزیه و تحلیل چرخش توزیع چگالی
– و …
شرکت سازنده: Skripnikov Leonid